Projeto 10
(13/11/2013)
1. Abra, com o auxílio do programa DNAsp, o arquivo exemplo
rp49#36.nex. Trata-se de amostras de sequências de um gene
nuclear (proteína ribossômica 49) de espécies de
Drosophila (D. subobscura,
população "st", D.
subobscura população "34", um
indivíduo de D.
madeirensis como grupo externo perto e um indivíduo
de D. guanche como grupo
externo distante.)
2. Verifique o número mínimo de eventos de
recombinação que ocorreram com a
população st e com a população 34 de D subobscura.
3. Verifique a diferenciação populacional entre
as populações de D.
subobscura.
4. Verifique se houve seleção nas duas
populações de D.
subobscura, com o teste de Fu e Li (artigo aqui).
5. Verifique se houve seleção nas duas
populações de D.
subobscura, com o teste de Fu e Li, com o uso de um grupo
externo (D. madeirensis)
6. Com o auxílio do programa Arlequin,
abra o programa exemplo 2popmic.arp (dentro de datafiles, microsat),
dados de microssatélites de duas populações do
caramujo Bulinus truncatus.
7. Verifique se as duas populações estão em
equilíbrio de Hardy-Weinberg.
8. Verifique a diferenciação entre as
populações com o teste exato de
diferenciação populacional.