Projeto 10

(Para 11/11/2015)


1. Abra, com o auxílio do programa DNAsp, o arquivo exemplo rp49#36.nex. Trata-se de amostras de sequências de um gene nuclear (proteína ribossômica 49) de espécies de Drosophila (D. subobscura, população "st", D. subobscura população "34", um indivíduo de D. madeirensis como grupo externo perto e um indivíduo de D. guanche como grupo externo distante.)

2. Verifique o número mínimo de eventos de recombinação que ocorreram com a população st e com a população 34 de D. subobscura.

3. Verifique a diferenciação populacional entre as populações de D. subobscura.

4. Verifique se houve seleção nas duas populações de D. subobscura, com o teste de Fu e Li (artigo aqui).

5. Verifique se houve seleção nas duas populações de D. subobscura, com o teste de Fu e Li, com o uso de um grupo externo (D. madeirensis)

6. Com o auxílio do programa Arlequin, abra o programa exemplo 2popmic.arp (dentro de datafiles, microsat), dados de microssatélites de duas populações do caramujo Bulinus truncatus.

7. Verifique se as duas populações estão em equilíbrio de Hardy-Weinberg.

8. Verifique a diferenciação entre as populações com o teste exato de diferenciação populacional.