Projeto 2
(para 21/08/2019, enviar até 28/08/2019)
Utilizando o programa Winpop, versão 2.5 (Pode ser carregado aqui). (Para computadores Windows)
Caso o programa não possa ser carregado, faça o
Projeto 2 alternativo.
Nas máquinas Linux, o simulador de Windows (wine) já está instalado. No entanto,
cada usuário deverá instalar o programa WinPop que já foi baixado.
Para isso, você deve logar na sua conta com o usuário e senha já fornecidos.
Clique em Atividades, depois, quando aparecer a janelinha de texto de busca,
digite terminal e clique no ícone correspondente.
No terminal digite "wine /var/WinPop2.5.exe" e use os parâmetros default para a
instalação.
1. Na simulação de deriva genética, para 40 populações, escolher um
tamanho (8<N<12 indivíduos), uma frequência gênica inicial
(0,25<p<0,50*) e um número de gerações (10<t<20). Gravar
a distribuição de frequências final. (Tomar o cuidado de escolher
uma única frequência gênica inicial ao longo de todo o projeto).
2. Utilizar os mesmos parâmetros para a cadeia de Markov para
distribuições de frequências gênicas. Anotar a distribuição de
freqüências final.
3. Comparar as distribuições (acumuladas, onde cada frequência
deverá ser multiplicada por 40 para os resultados da cadeia de
Markov) dos ítens 1 e 2 com o teste de Kolmogorov-Smirnoff
(Qui-quadrado com as distribuições acumuladas). Verificar a
significância em uma tabela de Qui-quadrado com 2N graus de
liberdade para p = 0,05. Tem uma tabela aqui.
Alternativamente, a probabilidade exata pode ser calculada aqui.
4. Repetir os passos 1 a 3, com a modificação que a simulação será
de seleção natural e deriva genética simultaneamente, utilizando
coeficientes de seleção s >> 1/2N (W1 = 1; W2 = 1 e W3 = 1-s).
5. Discutir os resultados.
Fórmula do Qui-quadrado:
Uma apostila de Genética de Populações está disponível aqui *Utilizar frequências
possíveis, que são de intervalos de 1/2N.