BIO-5706 Questionário 1

(para 16/08/2017, para ser respondido individualmente)

Texto: Apweiler, R. Sequence databases. Cap. 1 In: Baxevanis, A. D. e Oullette, B. F. F. (2007). Bioinformatics, a practical guide to the analysis of genes and proteins. John Wiley & Sons, Hoboken. pp 4-24

1. O que diferencia um banco de dados de sequências macromoleculares primário de um secundário? Forneça um exemplo de cada um deles.

2. Qual é o propósito do banco de dados RefSeq (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/RefSeq/)?

3. O que vem a ser o banco de dados UniProt (http://www.uniprot.org/) e quais são as diferenças entre o SwissProt e o trEMBL?

4. Discuta as seguintes características dos bancos de dados de sequências nucleotídicas:

a) redundância (como as informações estão repetidas)
b) amostragem (como a probabilidade de se encontrar um determinado tipo de sequência ou sequências de determinados organismos são maiores que de outras sequências)
c) acurácia (nas próprias sequências e como elas encontram-se interpretadas nos registros)