Questionário 8
(para 09/10/2017)
Texto: Pereira, S. L., Russo, C. A. M. e Miyaki, C. Y. e
Reconstrução filogenética. Métodos probabilísticos. In: Matioli, S.
R. e Fernandes, F.M.C. (2012). Biologia molecular e evolução. Holos,
editora e S.B.G., Ribeirão Preto.133-145.
1. Os modelos usados no MMV têm os mesmos nomes daqueles empregados
nos métodos que envolvem distância (JC69, F81, TN93, etc.).
Entretanto, a forma como esses modelos são usados nos dois métodos
diferem bastante. Explique a diferença.
2. Como pode ser feita a procura da árvore mais verossímil?
3. Explique sucintamente a estratégia dos quartetos.
4. Como as taxas heterogêneas de evolução molecular podem ser
tratadas com o emprego do MMV?
5. Exemplifique, explicando, um uso para o teste de razão de
verossimilhanças (LTR, de "likelihood ratio test").