Questionário 9
(para 4/11/2013)
Sugestão de leitura:
Pena, S.D. (2006) Thomas Bayes: o cara! Ciência Hoje 38(228):22-29. aqui.
Textos:
Pereira, S.L. (2012). Reconstrução
filogenética: Inferência bayesiana. Cap. 15. Matioli,
S.R. e Fernandes, F.M.C. Biologia molecular e
evolução. 2a edição. Holos/SBG,
Ribeirão Preto. 147-156.
Felsenstein, J. (2004). Bootstrap, jacknife, and permutation tests.
Cap. 20. Inferring Phylogenies. Sinauer Associates, Inc. Sunderland.
335-363.
1. Quais são os pontos sem controvérsia e quais
são os pontos controversos da utilização do
terorema de Bayes em inferência estatística?
2. No exemplo dos "dados imperfeitos", quais seriam as
diferenças nas apostas de um jogador que fosse apostar em uma
determinada combinação de números que é
adepto da inferência bayesiana e daquele que fosse adepto da
visão tradicional?
3. Quais são as vantagens da utilização das
probabilidades "a priori" na inferênca bayesiana de
filogenias?
4. Descreva sumariamente o método de bootstrap em filogenias
moleculares.
5. Descreva sumariamente o método de jacknife em filogenias
moleculares.
6. Qual é o efeito dos caracteres invariantes nos
métodos baseados em reamostragem?
7. Descreva sumariamente o método de bootstrap
paramétrico em filogenias moleculares.