Introdução à Bioinformática
Atividade 4
Objetivos:
Explorar a ferramenta BLAST e as propriedades de interligação
dos bancos de dados.
Atividade:
No site do banco de dados Uniprot (http://www.uniprot.org) clique
no ícone BLAST. Copie e cole a sequência abaixo na caixa de texto do
site. Troque o parâmetro "Target database" para
UniprotKB/Swiss-Prot. Em seguida clique no botão Run BLAST. Clique
na proteína com o melhor alinhamento. Utilize a página redirecionada
pelo site para responder as questões abaixo.
MSTAVLENPGLGRKLSDFGQETSYIEDNCNQNGAISLIFSLKEEVGALAKVLRLFEENDVNLTHIESRPSRLKKD
EYEFFTHLDKRSLPALTNIIKILRHDIGATVHELSRDKKKDTVPWFPRTIQELDRFANQILSYGAELDADHPGFK
DPVYRARRKQFADIAYNYRHGQPIPRVEYMEEEKKTWGTVFKTLKSLYKTHACYEYNHIFPLLEKYCGFHED
NIPQLEDVSQFLQTCTGFRLRPVAGLLSSRDFLGGLAFRVFHCTQYIRHGSKPMYTPEPDICHELLGHVPLFSDR
SFAQFSQEIGLASLGAPDEYIEKLATIYWFTVEFGLCKQGDSIKAYGAGLLSSFGELQYCLSEKPKLLPLELEKT
AIQNYTVTEFQPLYYVAESFNDAKEKVRNFAATIPRPFSVRYDPYTQRIEVLDNTQQLKILADSINSEIGILCSAL
QKIK
1.- Qual
o nome da proteína que teve melhor alinhamento? Qual o número de
acesso desta proteína?
2. -
Qual o nome do gene?
3.- Qual
o nome da doença mais comum que surge quando há deficiência desta
enzima?
4.- Quantos resíduos de aminoácidos esta proteína tem? Qual é o peso
molecular da proteína?
5.-
Quais vias metabólicas esta proteína participa?
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