Introdução à Bioinformática
Atividade 5
Objetivos:
Praticar alinhamento entre duas sequências com algoritmos local e
global.
Atividade:
Invente uma sequência nucleotídica de 15 nucleotídeos. Faça algumas
poucas modificações e compare a sequência original com a sequência
modificada, usando os algoritmos nas páginas abaixo. Lembre-se que o
eles diferem por um ser global (NW) e o outro local (SW). Repita o
procedimento alterando de outras formas (por exemplo com regiões
repetitivas).
http://rna.informatik.uni-freiburg.de/Teaching/index.jsp?toolName=Needleman-Wunsch
http://rna.informatik.uni-freiburg.de/Teaching/index.jsp?toolName=Smith-Waterman
Faça o mesmo com sequências proteicas (de até 10 resíduos de
aminoácidos), usando a página:
https://gtuckerkellogg.github.io/pairwise/demo/
Faça sua apreciação a respeito de sua experiência com alinhamentos
entre duas sequências de macromoléculas.
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