DNA lixo. Lixo?

   Principalmente nos eucariotos, uma parte apreciável do genoma tem função desconhecida. Tomando o cromossomo 21 do genoma humano como exemplo temos:
Proporções do 21
(adaptado de Makalowski, 2000)

Obs: A estimativa para repetições baseada em 76% do genoma, com o rascunho de 2000 foi de 42,5% (Li et al., 2000), um pouco abaixo daquela relativa ao cromossomo 21.
   Os pseudogenes, desde que foram descobertos, têm sido interpretados como fósseis moleculares, genes duplicados que perderam sua função por mutações com efeito negativo na sua expressão mas neutro no indivíduo devido à redundância.
   As repetições, tais como as seqüências Alu, podem ser encaradas como resquícios de infecções genômicas. Seu efeito na evolução molecular, no entanto, tem sido invocado como um fator de instabilidade genômica por propiciar:
1. "Pontos quentes" recombinacionais.
2. Embaralhamento de exons já que os mesmos, durante o emparelhamento na meiose, podem resultar em recombinação não homóloga.
3. Elementos que podem influenciar na transcrição, podendo ser encarados como elementos reguladores.
   As seqüências únicas podem ter função estrutural ("espaçadores", de interação com proteínas durante a condensação dos cromossomos na divisão celular), ou reguladora (em "splicing" alternativo, ligação com fatores de transcrição, sítios de poliadenilação, etc.)

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